Seminar Wahrscheinlichkeitstheorie
im Masterstudiengang MathematikAnzestrale Graphen in der Populationsgenetik
Anton Wakolbinger
Wintersemester 2015/16, Di 12-14, Raum 404
Betreuung des Seminars: Ute Lenz, lenz AT math.uni-frankfurt.de
Der anzestrale Selektionsgraph (ASG) und der anzestrale Rekombinationsgraph (ARG) beschreiben jeweils die potenziellen Ahnenlinien einer Stichprobe in einem populationsgenetischen Modell mit Selektion bzw. mit Rekombination. Wir wollen im Seminar sowohl die Arbeiten studieren, in denen diese Konstruktionen erstmals eingeführt wurden, als auch neuere Arbeiten, in denen Approximationen für große Selektionskoeffizienten bzw. große Rekombinationsraten betrachtet und analysiert werden.
Das Seminar richtet sich an Studierende mit Kenntnissen aus der (bzw. im Umfang der) Lehrveranstaltung "Stochastische Modelle der Populationsgenetik". Studierende, die am Seminar teilnehmen wollen, nehmen bitte noch vor Beginn der Vorlesungszeit Kontakt mit Ute Lenz oder mit mir auf.
Literatur:
S. Krone, C. Neuhauser,Ancestral processes with selection, Theoretical Population Biology 51 (1997), 210-237,
R. C. Griffiths, P. Marjoram, An ancestral recombination graph (1997), in: Progress in Population Genetics and Human Evolution, eds Donelly P., Tavaré S., editors, pp 257-270, Springer-Verlag.
C. Pokalyuk, P. Pfaffelhuber, The ancestral selection graph under strong directional selection, Theoretical Population Biology, 87 (2013), 25-33.
P. Fearnhead, P. Jekins, Y. Song, Tractable diffusion and coalescent processes for weakly correlated loci, Elect. J. Probab. 20 (2015), Art. 58,
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